Структурные подразделения научно-исследовательской части

1. Научно-исследовательский и испытательный центр «Криотрансэнерго» (НИИЦ «Криотрансэнерго», НИИЦ КТЭ НИЧ), включающий в себя лаборатории и группы (дир. И.В. Мартынюк);

2. Научно-исследовательская лаборатория «Системы диспетчерского контроля и управления» (НИЛ С ДКУ НИЧ) (рук. И.Д. Долгий);

3. Научно-исследовательская лаборатория «Электромотор» (НИЛ «Электромотор», НИЛ ЭМ НИЧ) (А.Р. Шайхиев);

4. Научно-исследовательская лаборатория «Тепловизионные измерения» (НИЛ ТИ НИЧ) (рук. О.А. Ворон);

5. Научно-исследовательская лаборатория «Информатизация и новые технологии систем электроснабжения» (НИЛ ИНТСЭл НИЧ) (рук. Ю.И. Жарков);

6. Отраслевая научно-исследовательская лаборатория «Региональные транспортные программы» (ОНИЛ РТП НИЧ) (рук. Э.А. Мамаев);

7. Научно-исследовательский центр «Транспортная триботехника» (НИЦ ТТНИЧ) (рук. В.В. Шаповалов);

8. Научно-внедренческий центр «Безопасность транспорта» (НВЦ БТ НИЧ) (нач. А.Э. Штанке);

9. Научно-исследовательской центр «Микропроцессорные технологии» (НИЦ МТ НИЧ) (рук. А.Е. Федорчук);

10. Объединенный научно-исследовательский и испытательный центр (ОНИИЦ НИЧ) (нач. Финоченко Т.А.), включающий следующие подразделения НИЧ:

10.1. Научно-производственный центр «Охрана труда» (НИЦ ОТ НИЧ), включающий в себя сертификационную лабораторию охраны труда в организациях и испытательную лабораторию (нач. Т.А. Финоченко);

10.2. Испытательный центр по сертификации средств железнодорожной автоматики и телемеханики (ИЦ ССЖАТ НИЧ РГУПС), включающий в себя сертификационную лабораторию (нач. В.В. Каменский);

10.3. Научно-исследовательская испытательная лаборатория «Испытание и мониторинг в гражданском и транспортном строительстве» (НИИЛ ИМГТС) (зав. лаб. Ермолов Я.М.);

10.4 Научно-исследовательский испытательный центр «Прочность и надежность конструкционных материалов» (нач. Морозкин И.С.);

10.5. Испытательная лаборатория смазочных материалов (ИЛ СМ НИЦ НТ), (зав. лаб. Е.С. Новиков);

11. Научно-испытательный центр «Нанотехнологии и трибосистемы» (НИЦ НТ НИЧ), (дир. А.И. Воропаев);

12. Научно-образовательный центр "Информационные и телекоммуникационные технологии" (НОЦ ИТТ НИЧ) (рук. А.Н. Гуда);

13. Научно-образовательный центр «Прикладная математика и информатика» (НОЦ ПМИ НИЧ) (рук. М.А. Бутакова);

14. Научно-образовательный центр «Диагностика объектов инженерной инфраструктуры» (НОЦ ДОИИ НИЧ), (рук. В.А. Явна);

15. Научно-образовательный центр «Транспортные тренажеры» (НОЦ ТТ НИЧ) (рук. В.Л. Шаповалов);

16. Научно-образовательный центр «Нанотехнологии и новые материалы» (НОЦ ННМ НИЧ) (рук. П.Г. Иваночкин);

17. Научно-образовательный центр «Подвижной состав» (НОЦ ПС НИЧ) (рук. А.Д. Петрушин). Положение о НОЦ;

18. Научно-исследовательский центр «Комплексная безопасность объектов транспорта» (НИЦ КБОТ НИЧ) (рук. Хрусталев А.В.);

19. Научно-образовательный центр «Комплексные проблемы экономики, управления и права» (НОЦ КПУЭП НИЧ) (рук. Скорев М.М.);

20. Научно-образовательный центр «Строительные материалы и технологии» (НОЦ СМТ НИЧ) (рук. А.А. Ревякин);

21. Научно-образовательный центр «Вагоны» (HОЦ «Вагоны» НИЧ) (рук. О.А. Ворон);

22. Научно-образовательный центр «Интеллектуальные системы организационного управления (НОЦ ИСОУ НИЧ) (рук. М.В. Колесников);

23. Научно-образовательный центр «Высокоскоростной транспорт на магнитном подвесе» (рук. В.А. Соломин);

24. Научно-образовательный центр «История Отечества и философия» (НОЦ ИОФ НИЧ) (рук. В.Г. Тахтамышев);

25. Научно-образовательный центр «Педагогика и психология» (НОЦ ПиП НИЧ) (рук. Т.Е. Исаева);

26. Научно-образовательный центр «Управление социально-политическими системами, коммуникационными процессами и человеческими ресурсами» (НОЦ УСПС НИЧ) (рук. В. В. Смеюха);

27. Научно-образовательный центр «Ресурсосберегающие технологии» (НОЦ РТ) (рук. В.Н. Носков);

28. Научно-образовательный центр «Аналитика и консалтинг: право, финансы, управление» (рук. проф. Федоров А.В.);

29.Межвузовский научно-образовательный центр управления транспортными системами (МНОЦУТС) (рук. Акперов И.Г.).

30. Научно-образовательный центр "Энергоэффективный тяговый подвижной состав" (НОЦ ЭТПС) (рук. Зарифьян А.А.)

а также на кафедрах университета.